29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1164 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  100 
 
 		 168 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  45.1 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  44.44 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3286  water stress/hypersensitive response protein  44.16 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000209158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2373  putative lipoprotein  46.2 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  43.51 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  30.52 
 
 		 280 aa  71.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  27.92 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  26.92 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  26.92 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.32 
 
 		 276 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  28.7 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.72 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  26.4 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  26.45 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  26.4 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  25.4 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  28.46 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0412  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.86 
 
 		 280 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  22.96 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1540  hypothetical protein  26.03 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000706166  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  23.7 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0619  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00260364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.7 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  22.92 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3438  Late embryogenesis abundant protein 2  23.74 
 
 		 304 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0750  hypothetical protein  24.67 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.864897  normal  0.55506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>