22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3866 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  333  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  78.53 
 
 		 164 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  46.01 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  44.79 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  42.04 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  43.57 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  42.86 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  43.57 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  47.69 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  40.65 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.44 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  24.59 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  28.03 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 160 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.32 
 
 		 167 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  27.27 
 
 		 165 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>