26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4130 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  340  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  78.53 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  50.34 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  47.85 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  43.31 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  42.14 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  41.43 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  47.33 
 
 		 136 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  42.65 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  41.43 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  39.35 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.7 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  29.31 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.01 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  31.01 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  26.49 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  23.77 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  25.83 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  24.63 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  22.31 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  22.7 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>