34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1115 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  100 
 
 		 167 aa  335  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  97.6 
 
 		 167 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  89.87 
 
 		 158 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  82.27 
 
 		 158 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  45.7 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  43.83 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  42.48 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  40.52 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  47.69 
 
 		 136 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.57 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.82 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  27.94 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  26.62 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  29.6 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  28.47 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.47 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  26.89 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  26.4 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  40.28 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  29.61 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  25.34 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  24.14 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  24.46 
 
 		 159 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.74 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.54 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  32.28 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  23.74 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>