34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4298 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  92.41 
 
 		 167 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  89.87 
 
 		 167 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  82.28 
 
 		 158 aa  253  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  49.69 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  48.68 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  45.28 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  48.37 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  41.61 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  41.18 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  48.46 
 
 		 136 aa  127  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  39.74 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  26.62 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.57 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.7 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  28.91 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  26.53 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  30.91 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.14 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  28.99 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.99 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  28.24 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  26.4 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  25 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.93 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  28.93 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  29.29 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  27.07 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.54 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  31.5 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  23.31 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>