36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  345  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  53.55 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  54.36 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  48.48 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  52.27 
 
 		 136 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  43.26 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  39.33 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  39.72 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  39.35 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  40.65 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  39.01 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  40 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.5 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  32.54 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.29 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  31.29 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  25.95 
 
 		 277 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  25.95 
 
 		 277 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  23.65 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  25.19 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  33.8 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  26.51 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  25.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  25.61 
 
 		 165 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.68 
 
 		 167 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  30.28 
 
 		 198 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  25.64 
 
 		 276 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.52 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  22.58 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  26.32 
 
 		 280 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>