42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0927 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  94.55 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3286  water stress/hypersensitive response protein  54.94 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000209158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  47.56 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2373  putative lipoprotein  46.45 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  46.32 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  30.07 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  29.41 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  29.41 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  28.28 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.23 
 
 		 276 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  30 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  25.38 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  26.15 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.38 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  25.98 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0412  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.72 
 
 		 280 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0750  hypothetical protein  27.19 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.864897  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  22.08 
 
 		 264 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  24.67 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1540  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000706166  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.71 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  25.83 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  26.55 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  28.19 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.19 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  33.71 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  31.11 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  25.61 
 
 		 167 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  25.53 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  27.36 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.32 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>