More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4423 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  63.24 
 
 		 544 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  61.76 
 
 		 544 aa  683    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  64.27 
 
 		 543 aa  721    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  65.07 
 
 		 544 aa  709    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  64.38 
 
 		 542 aa  715    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  65.56 
 
 		 543 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  63.9 
 
 		 543 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  59.38 
 
 		 563 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  63.96 
 
 		 542 aa  698    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  71.69 
 
 		 544 aa  789    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  62.98 
 
 		 543 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  60.93 
 
 		 552 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  63.47 
 
 		 543 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  60.49 
 
 		 552 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  60.59 
 
 		 543 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  74.95 
 
 		 543 aa  792    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  62.85 
 
 		 542 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  63.17 
 
 		 543 aa  697    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  62.8 
 
 		 543 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  63.7 
 
 		 543 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  63.79 
 
 		 544 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  60.59 
 
 		 543 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  63.35 
 
 		 543 aa  721    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  64.77 
 
 		 545 aa  701    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  62.34 
 
 		 542 aa  672    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  68.32 
 
 		 543 aa  721    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  64.53 
 
 		 544 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  61.88 
 
 		 543 aa  701    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.92 
 
 		 545 aa  664    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  65.62 
 
 		 544 aa  695    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  63.24 
 
 		 544 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  62.62 
 
 		 543 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  71.88 
 
 		 544 aa  790    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  64.09 
 
 		 566 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  61.58 
 
 		 544 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  62.32 
 
 		 544 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  62.62 
 
 		 543 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  100 
 
 		 543 aa  1096    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  71.32 
 
 		 544 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  56.54 
 
 		 542 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  63.9 
 
 		 543 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  58.65 
 
 		 552 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  54.4 
 
 		 558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  56.6 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  55.78 
 
 		 549 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  55.41 
 
 		 549 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  52.24 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  51.69 
 
 		 545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  51.87 
 
 		 545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  51.31 
 
 		 545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  51.88 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  49.64 
 
 		 556 aa  557  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  47.76 
 
 		 560 aa  528  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  45.9 
 
 		 1057 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  44.26 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  29.07 
 
 		 472 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.94 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.16 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  26.39 
 
 		 470 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.49 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.86 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.37 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  26.99 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.37 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.78 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.1 
 
 		 472 aa  127  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  30.51 
 
 		 473 aa  127  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.16 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  24.7 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.84 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  27.15 
 
 		 467 aa  120  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.74 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  25.49 
 
 		 475 aa  117  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.05 
 
 		 470 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  28.13 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.71 
 
 		 470 aa  115  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.38 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  26.92 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  24.48 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  25.22 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  26.91 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  26.65 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.65 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  26.16 
 
 		 490 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  30.1 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.91 
 
 		 475 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  27.79 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  25.75 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  24.2 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  28.07 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.72 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  27.1 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  26.65 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  29.07 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  27.42 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.75 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  22.61 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  29.19 
 
 		 548 aa  103  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.54 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  28.62 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>