More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2883 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  62.57 
 
 
544 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  66.73 
 
 
543 aa  744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  65.62 
 
 
543 aa  758    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  65.26 
 
 
543 aa  747    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  65.99 
 
 
542 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.81 
 
 
545 aa  664    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  64.77 
 
 
544 aa  710    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  99.26 
 
 
544 aa  1103    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  61.28 
 
 
563 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  64.04 
 
 
545 aa  704    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  100 
 
 
544 aa  1107    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  63.42 
 
 
543 aa  706    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  59.07 
 
 
552 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  60 
 
 
552 aa  645    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  59.93 
 
 
543 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  63.6 
 
 
543 aa  702    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  64.15 
 
 
543 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  65.13 
 
 
543 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  65.14 
 
 
544 aa  704    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  61.25 
 
 
542 aa  690    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  64.77 
 
 
544 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  66.24 
 
 
542 aa  720    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  66.54 
 
 
543 aa  697    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  63.53 
 
 
544 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  68.93 
 
 
543 aa  746    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  61.58 
 
 
543 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  65.99 
 
 
543 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  64.04 
 
 
544 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  64.94 
 
 
542 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  91.91 
 
 
544 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  64.95 
 
 
544 aa  740    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  65.26 
 
 
543 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  64.77 
 
 
544 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  65.01 
 
 
543 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  62.87 
 
 
543 aa  697    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  71.69 
 
 
543 aa  783    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  67.16 
 
 
544 aa  749    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  65.07 
 
 
566 aa  746    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  63.6 
 
 
543 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  58.79 
 
 
542 aa  676    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  59.93 
 
 
543 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  58.1 
 
 
552 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  53.26 
 
 
545 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  54.4 
 
 
558 aa  608  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  56.43 
 
 
549 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  56.55 
 
 
553 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  53.63 
 
 
545 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  56.61 
 
 
549 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  53.45 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  53.49 
 
 
561 aa  600  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  53.07 
 
 
545 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  47.58 
 
 
560 aa  540  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  47.94 
 
 
556 aa  534  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  46.93 
 
 
1057 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  43.58 
 
 
641 aa  458  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.53 
 
 
472 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.24 
 
 
472 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  26.06 
 
 
470 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  30.12 
 
 
472 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  26.33 
 
 
457 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.45 
 
 
474 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.73 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.26 
 
 
470 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  29.78 
 
 
467 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.74 
 
 
474 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.38 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.41 
 
 
472 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  29.4 
 
 
467 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.41 
 
 
518 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  29.78 
 
 
473 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.23 
 
 
470 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.66 
 
 
470 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  28.01 
 
 
470 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  27.66 
 
 
486 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  27.91 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.01 
 
 
475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  29.53 
 
 
488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  31.2 
 
 
551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.19 
 
 
470 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.16 
 
 
463 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.37 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  28.09 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  27.85 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  27.76 
 
 
469 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  25.7 
 
 
463 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  28.62 
 
 
549 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.1 
 
 
469 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.58 
 
 
469 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  27.96 
 
 
547 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  29.64 
 
 
550 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  25.37 
 
 
475 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  28.74 
 
 
460 aa  107  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  28.22 
 
 
547 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  24.38 
 
 
460 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  28.24 
 
 
549 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  26.14 
 
 
474 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.9 
 
 
475 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  25.65 
 
 
479 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  24.18 
 
 
458 aa  104  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.47 
 
 
475 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>