More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2020 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  62.8 
 
 		 543 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  61.71 
 
 		 542 aa  667    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  60.22 
 
 		 544 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  60.77 
 
 		 543 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  59.67 
 
 		 543 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  62.27 
 
 		 542 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  64.56 
 
 		 544 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  69.85 
 
 		 544 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  61.01 
 
 		 552 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  62.78 
 
 		 544 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  62.8 
 
 		 543 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  64.09 
 
 		 543 aa  702    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  59.74 
 
 		 563 aa  680    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  60.78 
 
 		 543 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  68.93 
 
 		 544 aa  759    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  61.42 
 
 		 552 aa  654    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  100 
 
 		 543 aa  1090    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  61.31 
 
 		 552 aa  659    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  68.57 
 
 		 544 aa  756    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  61.88 
 
 		 543 aa  685    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  63.27 
 
 		 544 aa  671    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  63.01 
 
 		 542 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  61.52 
 
 		 542 aa  651    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  71.45 
 
 		 543 aa  755    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  61.97 
 
 		 543 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  65.28 
 
 		 544 aa  648    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  62.98 
 
 		 543 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  60.48 
 
 		 544 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  61.97 
 
 		 543 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  62.75 
 
 		 545 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  61.58 
 
 		 544 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  59.38 
 
 		 544 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  65.06 
 
 		 543 aa  688    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  61.58 
 
 		 544 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  63.06 
 
 		 543 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  59.67 
 
 		 566 aa  662    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  74.95 
 
 		 543 aa  800    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  60.78 
 
 		 543 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  64.87 
 
 		 543 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  58.78 
 
 		 545 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  62.27 
 
 		 543 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  56.13 
 
 		 542 aa  633  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  57.92 
 
 		 553 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  54.29 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  56.53 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  56.53 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  53.73 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  53.36 
 
 		 545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  53.08 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  52.25 
 
 		 545 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  50.18 
 
 		 561 aa  561  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  46.06 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  46.4 
 
 		 1057 aa  499  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  45.14 
 
 		 560 aa  497  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  44.44 
 
 		 641 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  30.02 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.63 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.12 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.51 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.51 
 
 		 474 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  31.18 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.1 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  25 
 
 		 467 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.43 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.63 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  23.8 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  30.54 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  29.47 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.31 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.47 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  28.09 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.57 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  27.18 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.81 
 
 		 475 aa  124  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.19 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  24.29 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.48 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  27.48 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1209  phosphoglucomutase  28.95 
 
 		 547 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  27.06 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  23.48 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  28.57 
 
 		 551 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  29.16 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.9 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.66 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  25.73 
 
 		 474 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  27.83 
 
 		 474 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  26.62 
 
 		 414 aa  117  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  27.8 
 
 		 468 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.26 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  29.22 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  26.86 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.7 
 
 		 466 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  28.73 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  28.23 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  28.74 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.26 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  29.55 
 
 		 549 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  30.13 
 
 		 488 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  22.8 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>