More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2089 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  66.54 
 
 
543 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  63.97 
 
 
544 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  66.91 
 
 
544 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  65.19 
 
 
543 aa  742    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  69.14 
 
 
542 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  63.42 
 
 
544 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  64.46 
 
 
543 aa  752    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  61.58 
 
 
563 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  80.41 
 
 
544 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  65.26 
 
 
544 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  100 
 
 
543 aa  1083    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  62.25 
 
 
543 aa  706    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.18 
 
 
545 aa  665    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  65.62 
 
 
544 aa  706    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  66.73 
 
 
544 aa  723    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  58.01 
 
 
543 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  65.99 
 
 
542 aa  723    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  63.17 
 
 
543 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  68.51 
 
 
543 aa  754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  70.98 
 
 
542 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  64.46 
 
 
543 aa  739    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  58.01 
 
 
543 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  66.91 
 
 
544 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  86.56 
 
 
543 aa  913    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  62.87 
 
 
544 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  65.01 
 
 
566 aa  740    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  66.24 
 
 
543 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  76.24 
 
 
543 aa  841    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  76.61 
 
 
543 aa  845    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  62.43 
 
 
543 aa  699    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  67.47 
 
 
542 aa  759    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  65.56 
 
 
543 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  65.07 
 
 
544 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  64.87 
 
 
543 aa  674    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  67.1 
 
 
544 aa  745    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  63.42 
 
 
544 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  58.17 
 
 
542 aa  666    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  76.24 
 
 
543 aa  839    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  66.97 
 
 
545 aa  737    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  56.37 
 
 
552 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  55.62 
 
 
552 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  55.62 
 
 
552 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  51.53 
 
 
558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  48.44 
 
 
545 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  49.44 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  53.56 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  51.98 
 
 
553 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  53.18 
 
 
549 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  49.25 
 
 
545 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  48.5 
 
 
545 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  47.58 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  45.88 
 
 
556 aa  518  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  46.51 
 
 
560 aa  519  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  43.42 
 
 
1057 aa  487  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  42.45 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  30.88 
 
 
472 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  27.24 
 
 
457 aa  154  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.4 
 
 
474 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  30.04 
 
 
473 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.51 
 
 
472 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.3 
 
 
472 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.17 
 
 
474 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.92 
 
 
467 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.12 
 
 
472 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  30.69 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.42 
 
 
469 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  27.48 
 
 
467 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  26.35 
 
 
470 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  30.37 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.3 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.92 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  30.48 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  27.08 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.74 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  27.39 
 
 
470 aa  130  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  31.09 
 
 
547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  27.31 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  31.42 
 
 
488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  27.45 
 
 
475 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  29.23 
 
 
486 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.09 
 
 
469 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  29.4 
 
 
470 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.02 
 
 
475 aa  123  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  29.87 
 
 
468 aa  123  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.42 
 
 
466 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  30.65 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.76 
 
 
470 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  31.06 
 
 
547 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  26.04 
 
 
463 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.66 
 
 
518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.51 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  26.25 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  25.42 
 
 
474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  30.19 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  27.29 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  30.45 
 
 
547 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  29.93 
 
 
547 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  29.93 
 
 
547 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.45 
 
 
469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>