More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3351 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  63.1 
 
 
544 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  73.57 
 
 
543 aa  821    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  66.24 
 
 
544 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  66.17 
 
 
544 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  73.38 
 
 
566 aa  817    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  63.22 
 
 
563 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  65.13 
 
 
544 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  62.43 
 
 
545 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  66.54 
 
 
543 aa  713    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  64.88 
 
 
543 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  66.67 
 
 
543 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  77.9 
 
 
542 aa  890    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  62.92 
 
 
543 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  64.26 
 
 
544 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  64.26 
 
 
544 aa  719    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  61.97 
 
 
543 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  69.98 
 
 
542 aa  771    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  64.01 
 
 
543 aa  730    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  66.85 
 
 
542 aa  761    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  100 
 
 
543 aa  1112    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  60.19 
 
 
543 aa  671    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  98.16 
 
 
543 aa  1091    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  63.77 
 
 
544 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  69.19 
 
 
544 aa  784    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  73.38 
 
 
543 aa  815    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  81.77 
 
 
542 aa  898    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  65.79 
 
 
544 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  60.19 
 
 
543 aa  671    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  64.8 
 
 
543 aa  726    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  63.47 
 
 
543 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  63.7 
 
 
543 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  64.76 
 
 
544 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  62.92 
 
 
543 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  65.74 
 
 
544 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  58.64 
 
 
542 aa  658    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  58.77 
 
 
552 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  74.31 
 
 
543 aa  848    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  66.24 
 
 
544 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  59.34 
 
 
545 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  59.44 
 
 
543 aa  624  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  57.57 
 
 
552 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  57.57 
 
 
552 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  52.97 
 
 
558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  52.24 
 
 
545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  56.16 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  55.97 
 
 
549 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  52.34 
 
 
545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  55.06 
 
 
553 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  51.76 
 
 
545 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  51.68 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  51.44 
 
 
556 aa  558  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  49.1 
 
 
561 aa  548  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  48.72 
 
 
1057 aa  536  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  48.29 
 
 
560 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  45.79 
 
 
641 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  28.35 
 
 
472 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  26.16 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.16 
 
 
472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.71 
 
 
472 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.51 
 
 
472 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  27.73 
 
 
475 aa  136  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  28.33 
 
 
471 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  29.29 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.98 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  27.66 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.41 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  27.08 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.64 
 
 
466 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  27 
 
 
467 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.47 
 
 
474 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.95 
 
 
474 aa  124  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.73 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  27.86 
 
 
478 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  28.67 
 
 
486 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  25.9 
 
 
470 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  26.89 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.69 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.08 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  27.25 
 
 
474 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  26.26 
 
 
473 aa  117  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  26.79 
 
 
469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.8 
 
 
470 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  25.7 
 
 
463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.73 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.89 
 
 
475 aa  115  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.25 
 
 
463 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1755  phosphoglucomutase  27.44 
 
 
558 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  29.05 
 
 
488 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  28.87 
 
 
474 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.79 
 
 
469 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  26.34 
 
 
468 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  28.75 
 
 
547 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.57 
 
 
480 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  26.57 
 
 
480 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  26.37 
 
 
557 aa  107  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.77 
 
 
469 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  26.53 
 
 
503 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  23.19 
 
 
460 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  25.95 
 
 
490 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>