More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0607 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  62.76 
 
 
542 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  59.56 
 
 
543 aa  670    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  63.79 
 
 
543 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  100 
 
 
544 aa  1110    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  65.55 
 
 
542 aa  727    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  63.79 
 
 
543 aa  719    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  63.6 
 
 
566 aa  716    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  63.79 
 
 
543 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60 
 
 
545 aa  661    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  63.42 
 
 
563 aa  732    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  60.22 
 
 
543 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  62.57 
 
 
544 aa  696    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  63 
 
 
545 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  66.91 
 
 
543 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  58.41 
 
 
552 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  63.79 
 
 
544 aa  739    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  63.24 
 
 
543 aa  693    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
552 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  67.1 
 
 
544 aa  768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  63.1 
 
 
543 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  64.15 
 
 
543 aa  725    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  64.13 
 
 
544 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  62.01 
 
 
542 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  61.47 
 
 
544 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  59.56 
 
 
543 aa  670    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  63.6 
 
 
543 aa  721    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  62.87 
 
 
544 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  65.6 
 
 
544 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  64.15 
 
 
544 aa  758    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  63.1 
 
 
543 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  62.73 
 
 
543 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  62.57 
 
 
544 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  61.58 
 
 
543 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  63.97 
 
 
543 aa  730    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  61.76 
 
 
543 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  63.5 
 
 
543 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  62.36 
 
 
542 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  57.51 
 
 
542 aa  656    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  59.33 
 
 
552 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  62.87 
 
 
544 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  62.57 
 
 
544 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  55.27 
 
 
558 aa  630  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  59.74 
 
 
543 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  53.15 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  52.78 
 
 
545 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  52.78 
 
 
545 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  55.33 
 
 
553 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  55.06 
 
 
549 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  54.51 
 
 
549 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  52.04 
 
 
545 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  48.65 
 
 
561 aa  550  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  48.66 
 
 
556 aa  545  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  47.59 
 
 
1057 aa  540  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  45.97 
 
 
560 aa  519  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  43.99 
 
 
641 aa  480  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  27.56 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  27.97 
 
 
473 aa  130  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.66 
 
 
470 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  24.7 
 
 
457 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.62 
 
 
472 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.88 
 
 
467 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  28.57 
 
 
471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.02 
 
 
472 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.73 
 
 
472 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.32 
 
 
474 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.83 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  27.48 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  25.97 
 
 
458 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  28.29 
 
 
478 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  27.71 
 
 
486 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  26.18 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.46 
 
 
472 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  24.95 
 
 
467 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  32.11 
 
 
467 aa  113  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.26 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  24.5 
 
 
463 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.64 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.94 
 
 
469 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.56 
 
 
466 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  26.14 
 
 
486 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  27.88 
 
 
468 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  26.97 
 
 
474 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  22.15 
 
 
484 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  27.16 
 
 
474 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  26.46 
 
 
469 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  25.89 
 
 
486 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  22.18 
 
 
484 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.76 
 
 
463 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  25.37 
 
 
479 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  21.97 
 
 
484 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  24.3 
 
 
470 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  26.02 
 
 
475 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  24.12 
 
 
470 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  25.94 
 
 
485 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  22.88 
 
 
486 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.11 
 
 
475 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.22 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  24.16 
 
 
470 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  24.85 
 
 
480 aa  97.8  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.75 
 
 
484 aa  97.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>