More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3117 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  60.48 
 
 
544 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  59.44 
 
 
542 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  59.74 
 
 
544 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  66.54 
 
 
544 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  60.22 
 
 
543 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  60.37 
 
 
545 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  58.55 
 
 
543 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  60.29 
 
 
544 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  64.91 
 
 
544 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  57.35 
 
 
563 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  66.54 
 
 
544 aa  732    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  60.29 
 
 
544 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  59.44 
 
 
543 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  58.55 
 
 
543 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  63.35 
 
 
543 aa  700    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  61.47 
 
 
543 aa  676    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  59.93 
 
 
542 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  100 
 
 
543 aa  1097    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  59.01 
 
 
544 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  61.14 
 
 
543 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  58.17 
 
 
545 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  59.81 
 
 
543 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  66.54 
 
 
544 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  60.22 
 
 
566 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  63.54 
 
 
543 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  62.62 
 
 
543 aa  661    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  59.93 
 
 
544 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  59.67 
 
 
543 aa  651    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  60.29 
 
 
544 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  68.32 
 
 
543 aa  744    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  71.45 
 
 
543 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  60.3 
 
 
542 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  64.09 
 
 
543 aa  706    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  60.04 
 
 
543 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  61.78 
 
 
542 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  55.99 
 
 
542 aa  636    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  60.48 
 
 
544 aa  628  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  63.17 
 
 
543 aa  631  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  61.14 
 
 
543 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  56.93 
 
 
552 aa  601  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  56.18 
 
 
552 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  56.45 
 
 
552 aa  591  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  50.94 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  51.31 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  53.4 
 
 
553 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  49.82 
 
 
558 aa  552  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  50.56 
 
 
545 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  49.55 
 
 
561 aa  548  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  52.99 
 
 
549 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  49.63 
 
 
545 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  52.99 
 
 
549 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  46.77 
 
 
556 aa  513  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  45.77 
 
 
560 aa  500  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  45.33 
 
 
1057 aa  489  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  43.41 
 
 
641 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  29.2 
 
 
472 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.58 
 
 
472 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.44 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  26.95 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.17 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  25.53 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.24 
 
 
474 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.36 
 
 
472 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.58 
 
 
472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  31.23 
 
 
473 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.46 
 
 
467 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.98 
 
 
470 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  26.52 
 
 
470 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  31 
 
 
547 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.76 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.13 
 
 
518 aa  128  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  27.9 
 
 
548 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.15 
 
 
463 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  27.87 
 
 
470 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  29.55 
 
 
551 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  28.01 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1209  phosphoglucomutase  28.49 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  25.67 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  29.89 
 
 
545 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  30.59 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  29.68 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  28.26 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  28.31 
 
 
475 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.73 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  29.68 
 
 
545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.43 
 
 
475 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  26.12 
 
 
486 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  29.45 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  26.59 
 
 
475 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  26.41 
 
 
490 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  30.06 
 
 
545 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  29.95 
 
 
549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  27.51 
 
 
549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.86 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  30.28 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  26.56 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  23.95 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1518  phosphoglucomutase  31.46 
 
 
552 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186738  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0467  phosphoglucomutase  27.4 
 
 
553 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  28.7 
 
 
550 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>