More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1440 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3290  phosphoglucomutase  59.51 
 
 
544 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1440  phosphoglucomutase  100 
 
 
549 aa  1123    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00881  phosphoglucomutase  64.63 
 
 
545 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0392  phosphoglucomutase  66.97 
 
 
552 aa  776    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2297  phosphoglucomutase  68.51 
 
 
552 aa  795    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0327545 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0079  phosphoglucomutase  63.82 
 
 
545 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2833  phosphoglucomutase  59.51 
 
 
544 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0424  phosphoglucomutase  58.96 
 
 
544 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1925  phosphoglucomutase  57.65 
 
 
543 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.2228  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1084  phosphoglucomutase  59.29 
 
 
544 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00861  phosphoglucomutase  72.84 
 
 
553 aa  812    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662006  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00891  phosphoglucomutase  64.81 
 
 
545 aa  726    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.158625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00861  phosphoglucomutase  65.19 
 
 
545 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01411  phosphoglucomutase  98.54 
 
 
549 aa  1107    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02691  phosphoglucomutase  69.24 
 
 
552 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0156  phosphoglucomutase  58.58 
 
 
543 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.519  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1529  phosphoglucomutase  56.25 
 
 
544 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.7866  normal  0.0214781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2883  phosphoglucomutase  56.43 
 
 
544 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1719  phosphoglucomutase  54.97 
 
 
563 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1137  phosphoglucomutase  55.51 
 
 
544 aa  618  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.698422  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2020  phosphoglucomutase  56.53 
 
 
543 aa  616  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1484  phosphoglucomutase  55.06 
 
 
544 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0784872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3433  phosphoglucomutase  55.82 
 
 
543 aa  611  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0607  phosphoglucomutase  54.51 
 
 
544 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00807224  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1963  phosphoglucomutase  54.87 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2743  phosphoglucomutase  56.11 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2324  phosphoglucomutase  54.87 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.292761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0742  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  53.96 
 
 
545 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2749  phosphoglucomutase  55.04 
 
 
545 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2115  phosphoglucomutase  54.93 
 
 
544 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0065  phosphoglucomutase  54.33 
 
 
543 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.880642  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4423  phosphoglucomutase  55.41 
 
 
543 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1655  phosphoglucomutase  53.73 
 
 
542 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1888  phosphoglucomutase  54 
 
 
544 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_004310  BR0058  phosphoglucomutase  53.41 
 
 
543 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.557182  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0058  phosphoglucomutase  52.91 
 
 
566 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.194959  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0212  phosphoglucomutase  53.73 
 
 
542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3653  phosphoglucomutase  55.97 
 
 
543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3763  phosphoglucomutase  54.87 
 
 
542 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0539  phosphoglucomutase  53.73 
 
 
543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0844914  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3351  phosphoglucomutase  55.97 
 
 
543 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  53.36 
 
 
543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  52.43 
 
 
543 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  52.43 
 
 
543 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1175  phosphoglucomutase  52.34 
 
 
542 aa  561  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4649  phosphoglucomutase  51.57 
 
 
543 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2089  phosphoglucomutase  53.18 
 
 
543 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00430  phosphoglucomutase, putative  47.51 
 
 
561 aa  541  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3117  phosphoglucomutase  52.99 
 
 
543 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42958  predicted protein  49.09 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.76856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1738  phosphoglucomutase  51.22 
 
 
544 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77218  phosphoglucomutase  49.52 
 
 
560 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0137568  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02867  Phosphoglucomutase (PGM)(EC 5.4.2.2)(Glucose phosphomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P931]  46.75 
 
 
556 aa  498  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.231255 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  45.27 
 
 
1057 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50718  mutase phosphoglucomutase  43.39 
 
 
641 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.026414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  29.92 
 
 
472 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.18 
 
 
472 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.12 
 
 
474 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.35 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.33 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.54 
 
 
518 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.54 
 
 
472 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  28.82 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.64 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.37 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  27.92 
 
 
463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.38 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  27.35 
 
 
457 aa  123  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  27.67 
 
 
467 aa  123  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  27.31 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  27.47 
 
 
470 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  29 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  25.83 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  28.08 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.86 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  28.11 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  26.36 
 
 
488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.37 
 
 
469 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  28.02 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  25.68 
 
 
548 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  28.17 
 
 
458 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  24.26 
 
 
484 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  26.21 
 
 
548 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  26.2 
 
 
474 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  26.41 
 
 
548 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  25.16 
 
 
474 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.41 
 
 
463 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  27.93 
 
 
414 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  25.59 
 
 
486 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.54 
 
 
475 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  23.42 
 
 
484 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  24.06 
 
 
470 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  28.64 
 
 
550 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.27 
 
 
475 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.87 
 
 
466 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  27.27 
 
 
547 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  24.45 
 
 
470 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  25.27 
 
 
547 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  25.27 
 
 
547 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  25.42 
 
 
490 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>