42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1000 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  28.74 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  28 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  27.38 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  25.73 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  25.62 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  26.4 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2731  hypothetical protein  39.8 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  25.53 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  25.24 
 
 		 401 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  24.55 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  27.87 
 
 		 471 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1806  hypothetical protein  34.52 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  24 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  25.93 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  25.53 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  28.42 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  23.24 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  28.25 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  26.11 
 
 		 396 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1598  YbbR family protein  29.6 
 
 		 127 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  23.86 
 
 		 410 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  24.79 
 
 		 481 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  23.78 
 
 		 299 aa  51.6  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  21.51 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  26.19 
 
 		 443 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1498  hypothetical protein  30.19 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09483  hypothetical protein  23.5 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  22.36 
 
 		 411 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  23.77 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  25.87 
 
 		 437 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  25.49 
 
 		 334 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  19.16 
 
 		 483 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  20 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1655  hypothetical protein  23.7 
 
 		 345 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.965498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  28.87 
 
 		 414 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2636  hypothetical protein  26.4 
 
 		 127 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2457  hypothetical protein  28.3 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  21.02 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2369  hypothetical protein  27.36 
 
 		 129 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293093  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0162  YbbR family protein  26.02 
 
 		 280 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>