38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0371 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  100 
 
 		 311 aa  610  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  27.93 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  27.89 
 
 		 403 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  25.96 
 
 		 441 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  25.72 
 
 		 396 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  26.12 
 
 		 440 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  25.58 
 
 		 459 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  23.21 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  24.63 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  22.52 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  23.72 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  23.73 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  22.59 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0886  hypothetical protein  28.16 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1655  hypothetical protein  22.96 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.965498  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  23.14 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  24.53 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  23.73 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  22.71 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  19.6 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  23.61 
 
 		 481 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  21.67 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  19.72 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  22.33 
 
 		 495 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  22.01 
 
 		 493 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1567  hypothetical protein  24.03 
 
 		 365 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  23.58 
 
 		 493 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  23.58 
 
 		 496 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  23.58 
 
 		 496 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  17.95 
 
 		 401 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  23.58 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  23.58 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  23.58 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  24.14 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  21.02 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  23.27 
 
 		 495 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  23.08 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  30.53 
 
 		 471 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>