43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0935 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  100 
 
 
396 aa  767    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  30.56 
 
 
441 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  29.8 
 
 
440 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  30.1 
 
 
403 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  30.7 
 
 
316 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  27.48 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  27 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  26.12 
 
 
311 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  28.28 
 
 
414 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  29.43 
 
 
451 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  28.43 
 
 
451 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  24.88 
 
 
437 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  28.57 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  23.86 
 
 
443 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  26.87 
 
 
412 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  26.08 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  24.88 
 
 
401 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  25.5 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  24.43 
 
 
294 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  25.94 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  29.54 
 
 
322 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  25.24 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  28.57 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  27.65 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  24.84 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  28.32 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  22.89 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  26.11 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  26.88 
 
 
495 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  27.19 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  27.19 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  27.19 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  27.19 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  27.41 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  27.41 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  25.48 
 
 
495 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  25.89 
 
 
493 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  26.89 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0134  YbbR-like protein  22.91 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250086  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  25.58 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  25.64 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  23.6 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  25.15 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>