39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0362 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  100 
 
 
410 aa  801    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  27.48 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  22.49 
 
 
316 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  23.56 
 
 
437 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22.94 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  24.63 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  22.64 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  24.53 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  23.61 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  21.92 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  27.07 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  22.64 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  21.47 
 
 
408 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  24.9 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  24.9 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  25 
 
 
503 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  22.14 
 
 
481 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  19.37 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  24.9 
 
 
496 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  24.9 
 
 
496 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  24.5 
 
 
493 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  19.37 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  24.69 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  19.18 
 
 
451 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  24.27 
 
 
495 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  21.05 
 
 
459 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  20.79 
 
 
495 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  24.42 
 
 
294 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  19.6 
 
 
311 aa  56.6  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  25.88 
 
 
224 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  21.04 
 
 
493 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  21.79 
 
 
334 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  23.86 
 
 
218 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  21.17 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  23.71 
 
 
322 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  27.23 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  20.24 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  20.21 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  18.39 
 
 
300 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>