22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3551 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  100 
 
 		 351 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  28.42 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  26.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  27.23 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  25.37 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  28.83 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  25 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  25 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  25.95 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  31.11 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  24.84 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0484  hypothetical protein  31.76 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  26.84 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  23.47 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  22.08 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  23.81 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  21.13 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  23.96 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  25.77 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  23.61 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  33.33 
 
 		 396 aa  42.7  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>