32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0277 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  28.74 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  28.03 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  27.16 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  24.62 
 
 		 483 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  24.68 
 
 		 320 aa  72  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  26.11 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  23.94 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  20.75 
 
 		 470 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  24.88 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  22.93 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  25.3 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  26.11 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  23.18 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  25.15 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  30.65 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  25.88 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1598  YbbR family protein  32.73 
 
 		 127 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  22.22 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  29.25 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  26.47 
 
 		 351 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  25.42 
 
 		 333 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0162  YbbR family protein  27.08 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0109  hypothetical protein  23.14 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2636  hypothetical protein  28.93 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3366  protein of unknown function DUF147  20.31 
 
 		 388 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  25.2 
 
 		 334 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  20.8 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  24.86 
 
 		 401 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  20.11 
 
 		 311 aa  42  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  24.08 
 
 		 414 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>