28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1516 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  37.71 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  35.67 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  27.72 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  27.46 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  26.07 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  25.62 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  27.78 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  24.23 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  26.87 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  30.19 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  27.49 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  27.91 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  26.58 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  23.97 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  22.22 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  23.65 
 
 		 481 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  22.11 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  25.42 
 
 		 396 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  21.99 
 
 		 412 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  26.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  20.21 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  21.15 
 
 		 470 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0109  hypothetical protein  27.38 
 
 		 141 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  19.91 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  25.36 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  20.35 
 
 		 471 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  22.78 
 
 		 470 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>