21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1724 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  100 
 
 		 320 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  35 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  35.33 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  28.33 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  29.04 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  28.52 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  26.26 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  24.85 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  26.29 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  22.09 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  23.56 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  22.67 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  23.03 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  27.64 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1655  hypothetical protein  20.99 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.965498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  21.59 
 
 		 470 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  24.41 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  21.23 
 
 		 471 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1428  hypothetical protein  21.65 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.457755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  20.23 
 
 		 403 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  25.17 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>