39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0838 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  100 
 
 
408 aa  801    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  23.3 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  23.21 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22.33 
 
 
441 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  22.08 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  24.3 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  21.47 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  22.16 
 
 
503 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  26.46 
 
 
322 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  23.86 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  21.28 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  22.04 
 
 
493 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  24.18 
 
 
495 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  21.05 
 
 
294 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  22.42 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  21.71 
 
 
495 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  22.04 
 
 
493 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  22.04 
 
 
493 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  22.04 
 
 
496 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  22.04 
 
 
496 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  21.05 
 
 
495 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  22.75 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  22.38 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  23.82 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0134  YbbR-like protein  25.52 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250086  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  25.93 
 
 
218 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  22.57 
 
 
311 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  20.11 
 
 
481 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  22.18 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1404  hypothetical protein  26.2 
 
 
328 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0197256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  18.73 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  22.84 
 
 
451 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  25.15 
 
 
483 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0478  hypothetical protein  20.44 
 
 
319 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.808143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  23.34 
 
 
451 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  27.36 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0484  hypothetical protein  22.94 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  23.03 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>