14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1908 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  639    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0009  hypothetical protein  22.98 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.513062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  23.9 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  27.07 
 
 		 415 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  25.53 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  29.25 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  23.81 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  25.81 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  23.89 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  26.56 
 
 		 411 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  27.36 
 
 		 408 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  25.55 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  28.25 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  24.75 
 
 		 403 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>