34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1231 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  645    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0886  hypothetical protein  46.54 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0478  hypothetical protein  35.37 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.808143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1655  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.965498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  27.22 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  29.27 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  27.53 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  29.36 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  27.08 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  27.07 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  27.22 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  27.53 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  27.22 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  27.53 
 
 		 496 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  27.53 
 
 		 496 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  27.53 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  27.53 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  27.22 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  27.53 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  26.9 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2194  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2232  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1567  hypothetical protein  23.08 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  26.61 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  26.15 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  26.65 
 
 		 451 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  24.84 
 
 		 451 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  22.95 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  25.55 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  20.88 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  26.87 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  25.68 
 
 		 415 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  27.37 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>