49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0153 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  100 
 
 		 412 aa  823    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  61.07 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  35.8 
 
 		 503 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  35.87 
 
 		 481 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  34.91 
 
 		 493 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  34.91 
 
 		 493 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  34.91 
 
 		 493 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  34.67 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  34.67 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  34.67 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  34.2 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  34.2 
 
 		 495 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  34.91 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  33.65 
 
 		 322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  27.39 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  26.92 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  29.91 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  28.14 
 
 		 299 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2232  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2194  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0478  hypothetical protein  27.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.808143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1655  hypothetical protein  26.61 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.965498  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1567  hypothetical protein  29.19 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0886  hypothetical protein  26.09 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  26.27 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  26.67 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  27.65 
 
 		 316 aa  99.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  25.88 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  25.51 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  28.66 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  26.56 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  23.67 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  24.68 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  23.61 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  24.34 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  26.72 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  21.28 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  23.73 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  22.94 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  24.55 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  20.7 
 
 		 459 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0484  hypothetical protein  26.76 
 
 		 335 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  24.41 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  25.81 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  27.78 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  21.99 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  28.04 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  23.46 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  25.63 
 
 		 299 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>