23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0256 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  100 
 
 		 305 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  35 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  29.77 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  31.8 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  28.67 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  33.14 
 
 		 483 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  27.16 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  25.73 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  28.65 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  25 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  22.86 
 
 		 470 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  24.57 
 
 		 470 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  24.65 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22.71 
 
 		 441 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  24.41 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  27.92 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  25.23 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0484  hypothetical protein  23.26 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0109  hypothetical protein  21.37 
 
 		 141 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  26.98 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  25.97 
 
 		 239 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>