44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0833 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  100 
 
 		 437 aa  865    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  28.7 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  26.27 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  24.59 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  24.43 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  26.25 
 
 		 401 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  23.56 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  24.88 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  29.17 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  26 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  22.7 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  22.27 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  23.58 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  22.05 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  25.65 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  23.57 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  22.27 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  23.4 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  22.27 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  22.27 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  23.19 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  24.33 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  27.59 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  22.71 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  25 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  26.61 
 
 		 451 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  22.69 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  22.71 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  21.2 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  29.71 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  21.56 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  21.56 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  23.18 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  27.49 
 
 		 300 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  22.18 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1567  hypothetical protein  26.45 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  25.87 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  27.92 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  28.57 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  24.31 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  22.41 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0134  YbbR-like protein  24.74 
 
 		 327 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>