18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1784 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  100 
 
 		 300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  49.5 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  36.42 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  34.75 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  31.8 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  34.97 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  28.11 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  25.93 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  25.31 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  30.49 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  29.71 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  18.35 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  18.36 
 
 		 410 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  29.27 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0478  hypothetical protein  21.15 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.808143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  26.92 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  21.01 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  22.52 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>