13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1714 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  34.23 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  34.75 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  26.07 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  28.67 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  29.67 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  25.8 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  25.15 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  24.34 
 
 		 483 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  26.28 
 
 		 415 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  23.77 
 
 		 218 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  24.14 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  28.25 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>