27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2187 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  100 
 
 		 333 aa  657    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  22.71 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  23.39 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  23.41 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  25.42 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  23.9 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  24.53 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  27.5 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09483  hypothetical protein  28.99 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  24.71 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  27.16 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  20.83 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  29.08 
 
 		 471 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  22.28 
 
 		 470 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  23.27 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  22.08 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  23.25 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  24.44 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  23.25 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  23.25 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  24.44 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  23.89 
 
 		 495 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  24.62 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  23.46 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  25.42 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  24.62 
 
 		 441 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  20.75 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>