35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1165 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  100 
 
 		 403 aa  789    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  37.13 
 
 		 414 aa  265  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  30.1 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  30.22 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  27.89 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  23.83 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  23.67 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  24.53 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  23.72 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  22.94 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  24.18 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  22.7 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22.44 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  23 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  25.42 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  25.18 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  26.54 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  26.24 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  22.51 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  24.85 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  25.86 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  22.64 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  26.72 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  24.55 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  25.15 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  26.41 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  26.41 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  26.29 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  26.29 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  23.21 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  24.24 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  20.87 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  18.73 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  19.91 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  27.37 
 
 		 321 aa  43.5  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>