114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2559 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2559  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.026679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  26.44 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  26.97 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  29.5 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1910  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  26 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1904  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  0.448983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1968  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1366  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0144221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1550  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2334  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  25.7 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3549  hypothetical protein  26.54 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  29.91 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  29.54 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  29.54 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  29.54 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  29.83 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  29.11 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  29.46 
 
 		 281 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 280 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  29.11 
 
 		 280 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  29.11 
 
 		 280 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  30.32 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  29.46 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  29.02 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  30.32 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  27.64 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  27.62 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  27.62 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  27.62 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  25.91 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  27.62 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  27.62 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0701  hypothetical protein  24.91 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3610  hypothetical protein  24.91 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0588613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3733  hypothetical protein  24.91 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  27.62 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3542  hypothetical protein  24.91 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000309634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  23.93 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  27 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  27.97 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  26.69 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  26.69 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  27.27 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0807  hypothetical protein  23.16 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  28 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  25.93 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  27.46 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  26.18 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  26.18 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0923  hypothetical protein  23.53 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00500148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3165  hypothetical protein  23.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0801  hypothetical protein  23.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0773  hypothetical protein  23.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  25.42 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  25.81 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0726  hypothetical protein  26.69 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.935088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  26.17 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2563  hypothetical protein  23.44 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.610667  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2906  hypothetical protein  24.54 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.849831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3829  hypothetical protein  23.05 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  22.39 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  25.1 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  37.62 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  22.93 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3676  hypothetical protein  22.61 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  23.11 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  26.07 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3123  hypothetical protein  23.77 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.292454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3588  hypothetical protein  52.17 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1473  hypothetical protein  29.55 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.797183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  45.45 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3452  hypothetical protein  22.99 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  45.45 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  45.45 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  24.42 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>