126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0922 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  99.29 
 
 
280 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  99.29 
 
 
280 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  99.29 
 
 
280 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  97.86 
 
 
280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  79.29 
 
 
280 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  80.71 
 
 
284 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  80.36 
 
 
280 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  80.36 
 
 
280 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  80.36 
 
 
280 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  80 
 
 
280 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  79.64 
 
 
280 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  75.9 
 
 
280 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  74.64 
 
 
280 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  72.76 
 
 
283 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  61.17 
 
 
282 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  60.51 
 
 
282 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  58.82 
 
 
281 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  58.82 
 
 
281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  58.82 
 
 
281 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  50.36 
 
 
280 aa  288  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  53.7 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  52.01 
 
 
282 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  51.11 
 
 
283 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  51.1 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  52.04 
 
 
289 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  50.92 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  50.92 
 
 
282 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  50.92 
 
 
282 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  48.9 
 
 
283 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  46.91 
 
 
290 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  46.1 
 
 
281 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1473  hypothetical protein  49.76 
 
 
218 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.797183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  39.57 
 
 
281 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 
281 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  36.09 
 
 
271 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  39.5 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  40.31 
 
 
281 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  34.42 
 
 
284 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  34.94 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  34.94 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  33.08 
 
 
266 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  40.98 
 
 
282 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  41.2 
 
 
283 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  36.26 
 
 
278 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  36.99 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  41.07 
 
 
284 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  34.2 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2554  hypothetical protein  38.06 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11238  normal  0.887248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  28.31 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  38.03 
 
 
245 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  25.87 
 
 
269 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  26.38 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6509  predicted protein  34.42 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236184  normal  0.418162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2055  hypothetical protein  30.33 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  28.73 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  29.47 
 
 
281 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
269 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 
269 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
269 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
269 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
269 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
269 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4618  hypothetical protein  33.61 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4478  hypothetical protein  33.61 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242324  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4602  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  24.32 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2893  hypothetical protein  28.86 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19860  hypothetical protein  33.76 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0820  hypothetical protein  32.35 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1550  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1904  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  0.448983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1968  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1910  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1366  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0144221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2334  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2559  hypothetical protein  29.54 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.026679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1707  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0499  hypothetical protein  33.17 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.623817  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0176  hypothetical protein  34.8 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.244166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3542  hypothetical protein  30.66 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000309634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0701  hypothetical protein  30.66 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3610  hypothetical protein  30.66 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0588613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3733  hypothetical protein  30.66 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0284  hypothetical protein  32.46 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  0.168748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5838  hypothetical protein  28.25 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  27.75 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>