117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0042 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  81.65 
 
 		 278 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  36.19 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  39.84 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  39.84 
 
 		 265 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  39.02 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  38.72 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  41.67 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  42.05 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  42.05 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  42.05 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  42.42 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  41.09 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  41.29 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  41.29 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  40.46 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  38.55 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  38.17 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  37.07 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  36.64 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  42.01 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  36.15 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  36.15 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  37.78 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  35.77 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  35.77 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  38.01 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  39.15 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  35.25 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  39.15 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  39.15 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  36.78 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  38.68 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  38.68 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  38.24 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  34.62 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  33.96 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  28.7 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  34.23 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  33.85 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2554  hypothetical protein  37.89 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11238  normal  0.887248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  35.96 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  33.86 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  35.17 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  34.7 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  34.33 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  36.71 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3860  hypothetical protein  35.9 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493821  normal  0.355777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2055  hypothetical protein  29.36 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0869  putative transcritional regulator  33.51 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6509  predicted protein  31.28 
 
 		 216 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236184  normal  0.418162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0499  hypothetical protein  37.34 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.623817  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0176  hypothetical protein  32.34 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.244166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  29.74 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5838  hypothetical protein  33.12 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  29.82 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4602  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4478  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  24.81 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1473  hypothetical protein  28.42 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.797183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4618  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0284  hypothetical protein  29.76 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  0.168748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0753  hypothetical protein  29.75 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  25.11 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3588  hypothetical protein  32.23 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2893  hypothetical protein  29.94 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2334  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0820  hypothetical protein  29.28 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  23.01 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1904  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  0.448983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1968  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1366  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0144221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1550  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1910  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1027  hypothetical protein  31.94 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  23.94 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1191  hypothetical protein  30.56 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3249  hypothetical protein  27.93 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>