More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0502 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0502  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  100 
 
 
139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  70.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0457  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  66.97 
 
 
111 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3572  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  66.97 
 
 
111 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0453  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  66.97 
 
 
111 aa  147  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634054  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4313  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  66.07 
 
 
112 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  66.06 
 
 
111 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2207  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  66.04 
 
 
117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.602689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2340  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  62.28 
 
 
124 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0156483  normal  0.586364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1554  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  60.48 
 
 
143 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3879  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.29 
 
 
112 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44220  Peptidylprolyl isomerase  60.71 
 
 
113 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3640  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.29 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0746275  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.22 
 
 
111 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.22 
 
 
111 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.22 
 
 
111 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4028  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.22 
 
 
111 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1971  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.98 
 
 
113 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000209328  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3576  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  66.04 
 
 
112 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.515977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2529  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  62.5 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3391  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  62.39 
 
 
111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1404  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.39 
 
 
113 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16320  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  62.04 
 
 
113 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0245  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.27 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.65 
 
 
113 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  48.65 
 
 
113 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  48.65 
 
 
113 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.65 
 
 
113 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.65 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.65 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.65 
 
 
113 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  48.65 
 
 
113 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  47.75 
 
 
113 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.65 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  47.2 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.18 
 
 
113 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  48.18 
 
 
112 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.75 
 
 
112 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  42.86 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  44.25 
 
 
203 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  50.49 
 
 
114 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.49 
 
 
237 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  44.54 
 
 
254 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  46.36 
 
 
114 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.96 
 
 
190 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  50.96 
 
 
197 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.96 
 
 
190 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  42.98 
 
 
143 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.96 
 
 
190 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.96 
 
 
190 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  38.4 
 
 
180 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  38.4 
 
 
180 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0505  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.85 
 
 
261 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.02 
 
 
108 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  42.28 
 
 
165 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.15 
 
 
117 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.15 
 
 
117 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.35 
 
 
117 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.92 
 
 
184 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.46 
 
 
107 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.92 
 
 
184 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  43.7 
 
 
199 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  43.1 
 
 
154 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  46.3 
 
 
119 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  47 
 
 
155 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  46.3 
 
 
119 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47 
 
 
155 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  49.04 
 
 
210 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.46 
 
 
107 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  42.24 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.3 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  40.71 
 
 
179 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  47.17 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1864  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44.95 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  46.3 
 
 
119 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2957  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.67 
 
 
163 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  37.24 
 
 
187 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1803  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.49 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0780  putative fkbp-type peptidyl-prolyl cis- transisomerase signal peptide protein  47.62 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  47.22 
 
 
115 aa  97.1  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1882  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.49 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1935  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  48.51 
 
 
133 aa  96.7  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1738  Peptidylprolyl isomerase  48.51 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.127395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1658  Peptidylprolyl isomerase  44.04 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0122664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4462  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.62 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.389976  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4907  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  43.12 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.27 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1565  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signal peptide protein  45.19 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4454  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.15 
 
 
263 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03986  putative periplasmic peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.74 
 
 
261 aa  95.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000158927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3988  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.62 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000736493  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  44.44 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1988  Peptidylprolyl isomerase  42.2 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2686  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  43.12 
 
 
133 aa  94  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.590107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.27 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5623  peptidylprolyl isomerase  45.19 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588755  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0484  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44.14 
 
 
262 aa  93.6  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  46.3 
 
 
115 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.73 
 
 
143 aa  93.2  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>