More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0784 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
117 aa  238  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  93.16 
 
 
117 aa  220  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  91.45 
 
 
117 aa  217  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  86.96 
 
 
115 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  84.35 
 
 
115 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  81.2 
 
 
117 aa  192  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  76.92 
 
 
119 aa  186  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  76.92 
 
 
119 aa  186  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  77.39 
 
 
117 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  77.78 
 
 
119 aa  184  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  77.39 
 
 
116 aa  184  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  78.76 
 
 
115 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  74.78 
 
 
117 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  77.78 
 
 
114 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  75.21 
 
 
113 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  75.21 
 
 
113 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0691  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  75.42 
 
 
119 aa  177  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  74.36 
 
 
113 aa  176  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  75.22 
 
 
117 aa  176  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  74.36 
 
 
113 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  74.36 
 
 
113 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  74.36 
 
 
113 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  74.36 
 
 
113 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  76.07 
 
 
113 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  72.57 
 
 
154 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  73.5 
 
 
113 aa  173  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  76.99 
 
 
112 aa  173  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  72.65 
 
 
114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  74.36 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  72.57 
 
 
154 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  71.79 
 
 
113 aa  169  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  71.79 
 
 
113 aa  169  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  70.94 
 
 
113 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.07 
 
 
138 aa  167  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.27 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2171  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  70.27 
 
 
154 aa  163  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125319  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  68.14 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  70.8 
 
 
115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.43 
 
 
143 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  66.67 
 
 
154 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  66.96 
 
 
203 aa  157  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.03 
 
 
180 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  69.03 
 
 
180 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0365  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  69.09 
 
 
115 aa  154  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.22 
 
 
140 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.48 
 
 
140 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  64.91 
 
 
199 aa  150  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.04 
 
 
149 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.54 
 
 
237 aa  149  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.49 
 
 
179 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.54 
 
 
155 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.18 
 
 
140 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.18 
 
 
140 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.18 
 
 
140 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  64.6 
 
 
165 aa  147  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  62.93 
 
 
174 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  67.27 
 
 
108 aa  146  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  66.67 
 
 
155 aa  146  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  66.37 
 
 
199 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  66.37 
 
 
190 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  69.09 
 
 
210 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  65.49 
 
 
190 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  65.49 
 
 
190 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  64.6 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  69.64 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  66.36 
 
 
197 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60 
 
 
143 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  68.14 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0751  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  62.04 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  56.03 
 
 
167 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  67.86 
 
 
155 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.04 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.25 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.26 
 
 
112 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2101  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  58.18 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0147755  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.41 
 
 
254 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0379  peptidylprolyl isomerase  62.5 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.687673  normal  0.209707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2244  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.18 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502602  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5503  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.04 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00337185  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  60.71 
 
 
184 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  60.71 
 
 
184 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
140 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.75 
 
 
107 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4883  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.33 
 
 
125 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0338  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.41 
 
 
138 aa  120  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00440311  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1694  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.41 
 
 
122 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1877  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.33 
 
 
125 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  59.81 
 
 
107 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  53.64 
 
 
112 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1803  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  59.81 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4040  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.03 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200056  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1882  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  59.81 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1435  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.91 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.585124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.48 
 
 
124 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  52.68 
 
 
310 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.78 
 
 
310 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44220  Peptidylprolyl isomerase  50.91 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  52.78 
 
 
111 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>