More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2816 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  84.31 
 
 
154 aa  256  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  79.08 
 
 
154 aa  234  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  75.74 
 
 
155 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  86.09 
 
 
115 aa  214  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2171  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  71.24 
 
 
154 aa  208  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125319  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  68.63 
 
 
154 aa  203  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.67 
 
 
140 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.34 
 
 
138 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.23 
 
 
140 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.8 
 
 
149 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.72 
 
 
179 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  71.68 
 
 
115 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  72.97 
 
 
119 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  72.97 
 
 
119 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  72.97 
 
 
116 aa  168  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.41 
 
 
140 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.41 
 
 
140 aa  167  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.41 
 
 
140 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  64.39 
 
 
203 aa  167  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.97 
 
 
117 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  70.27 
 
 
115 aa  166  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  71.05 
 
 
119 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  70.27 
 
 
117 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  60.84 
 
 
180 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  69.91 
 
 
117 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.84 
 
 
180 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.89 
 
 
143 aa  163  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  66.95 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.37 
 
 
117 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  65.04 
 
 
165 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  68.47 
 
 
117 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.06 
 
 
159 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.16 
 
 
117 aa  156  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  66.67 
 
 
117 aa  156  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  66.07 
 
 
115 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.29 
 
 
155 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  58.27 
 
 
155 aa  150  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  62.83 
 
 
114 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0691  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.39 
 
 
119 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  60.83 
 
 
199 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.79 
 
 
114 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  64.35 
 
 
112 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0365  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  62.83 
 
 
115 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.48 
 
 
113 aa  146  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.6 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  66.07 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  52.82 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.29 
 
 
113 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  65.18 
 
 
113 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  65.18 
 
 
113 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.04 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  64.86 
 
 
108 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  64.29 
 
 
113 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0751  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.05 
 
 
153 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  62.5 
 
 
210 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.33 
 
 
143 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  63.39 
 
 
113 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  63.39 
 
 
113 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.39 
 
 
113 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.96 
 
 
113 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  63.96 
 
 
113 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  62.28 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  59.68 
 
 
199 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  63.06 
 
 
197 aa  136  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  59.73 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  67.8 
 
 
138 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  55.64 
 
 
190 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  68.64 
 
 
155 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  54.89 
 
 
190 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  56.92 
 
 
190 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0379  peptidylprolyl isomerase  56.55 
 
 
152 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.687673  normal  0.209707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.77 
 
 
237 aa  131  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  58.27 
 
 
190 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.24 
 
 
187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1435  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.11 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.585124  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2101  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.25 
 
 
125 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0147755  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2244  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.46 
 
 
125 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502602  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.14 
 
 
254 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19690  predicted protein  60.53 
 
 
173 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.266789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.46 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.58 
 
 
310 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1075  peptidylprolyl isomerase  47.86 
 
 
139 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23489  predicted protein  61.05 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00699438  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.37 
 
 
310 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3274  Peptidylprolyl isomerase  50.77 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  52.89 
 
 
184 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.19 
 
 
107 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1300  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signal peptide protein  51.24 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.19 
 
 
107 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5503  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.57 
 
 
124 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00337185  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  55.26 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0338  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  44.29 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00440311  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02370  FK506 binding protein 2, putative  56.38 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  52.07 
 
 
184 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1877  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.89 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3652  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  52.17 
 
 
297 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.89 
 
 
310 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  50.93 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.29 
 
 
124 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>