More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3178 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  100 
 
 
112 aa  226  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  71.56 
 
 
174 aa  160  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  68.75 
 
 
143 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.64 
 
 
159 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  71.05 
 
 
140 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  71.05 
 
 
140 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  68.18 
 
 
180 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  68.18 
 
 
180 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  69.09 
 
 
165 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.09 
 
 
179 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  67.29 
 
 
203 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.67 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  64.04 
 
 
154 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  63.16 
 
 
154 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.35 
 
 
140 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.35 
 
 
140 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.35 
 
 
140 aa  146  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  65.49 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  65.49 
 
 
116 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.74 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  64.91 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  65.14 
 
 
155 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  66.06 
 
 
113 aa  143  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.97 
 
 
113 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.06 
 
 
113 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  66.97 
 
 
113 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  65.14 
 
 
113 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  65.14 
 
 
113 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  64.86 
 
 
167 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  66.06 
 
 
112 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.06 
 
 
113 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  64.55 
 
 
114 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.04 
 
 
152 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.06 
 
 
112 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.14 
 
 
113 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  62.39 
 
 
199 aa  141  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  65.14 
 
 
113 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  65.14 
 
 
113 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  64.22 
 
 
113 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  62.61 
 
 
115 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  68.22 
 
 
157 aa  140  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  61.74 
 
 
117 aa  139  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  61.74 
 
 
115 aa  139  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.39 
 
 
117 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  64.6 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  64.6 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  65.42 
 
 
108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  64.22 
 
 
113 aa  137  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  63.72 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  62.28 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  60.87 
 
 
117 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  61.95 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.89 
 
 
237 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  65.14 
 
 
138 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  65.74 
 
 
155 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.87 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  61.95 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2171  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  60 
 
 
154 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125319  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  62.62 
 
 
197 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  59.65 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  64.42 
 
 
140 aa  130  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  59.13 
 
 
117 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54718  FK506 binding protein proline rotamase rapamycin-binding protein  64.84 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.26 
 
 
117 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  59.63 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  56.25 
 
 
310 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0691  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.26 
 
 
119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  59.46 
 
 
210 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  57.66 
 
 
310 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.48 
 
 
187 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02370  FK506 binding protein 2, putative  58.51 
 
 
141 aa  124  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  59.46 
 
 
190 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  56.6 
 
 
165 aa  123  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  58.56 
 
 
190 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  58.56 
 
 
190 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3652  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  55.96 
 
 
297 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4907  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.36 
 
 
146 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0365  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.52 
 
 
115 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5623  peptidylprolyl isomerase  56.36 
 
 
131 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588755  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  60.75 
 
 
199 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  59.22 
 
 
107 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  57.66 
 
 
184 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1988  Peptidylprolyl isomerase  55.45 
 
 
137 aa  119  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  56.76 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  61.22 
 
 
254 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.88 
 
 
310 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  56.76 
 
 
184 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0919  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  55.05 
 
 
206 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0607  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.48 
 
 
206 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000591521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6522  Peptidylprolyl isomerase  55.05 
 
 
258 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00743  FKBP-type 22KD peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  57.41 
 
 
206 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.63 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0827  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.55 
 
 
255 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.071288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4883  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.45 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0968  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.96 
 
 
259 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000467917  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3462  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FklB  55.05 
 
 
213 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4022  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.41 
 
 
256 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.28 
 
 
107 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1658  Peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
137 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0122664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>