More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54718 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54718  FK506 binding protein proline rotamase rapamycin-binding protein  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0243  peptidylprolyl isomerase  64.15 
 
 
108 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0565946  normal  0.433333 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01800  macrolide-binding protein FKBP12  62.5 
 
 
134 aa  138  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  64 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.84 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  60.58 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  64.29 
 
 
203 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03598  FK506-binding protein 1A (FKBP)(FkbA)(EC 5.2.1.8)(Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase)(PPIase)(Rapamycin-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q6KBA8]  59.43 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  65 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  59.41 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30615  predicted protein  57.69 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.853139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  59 
 
 
165 aa  123  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23489  predicted protein  57.28 
 
 
125 aa  123  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00699438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60 
 
 
179 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.16 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.77 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.16 
 
 
140 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.16 
 
 
140 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.22 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.61 
 
 
143 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02370  FK506 binding protein 2, putative  57.78 
 
 
141 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44220  Peptidylprolyl isomerase  52.88 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  50.96 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  57.61 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.24 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.96 
 
 
310 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  52.88 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2340  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.92 
 
 
124 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0156483  normal  0.586364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.77 
 
 
149 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  51.46 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  53.85 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3640  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0746275  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2207  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  49.51 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.602689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  49.14 
 
 
154 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  53.19 
 
 
117 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4313  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  52.88 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2529  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  51.92 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  51.92 
 
 
113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  55.06 
 
 
199 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.45 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3879  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16320  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  50 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1554  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  48.21 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.17 
 
 
140 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.92 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  50.96 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.96 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  50.96 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.17 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.53 
 
 
111 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  50.89 
 
 
116 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1404  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.04 
 
 
113 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.53 
 
 
111 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4028  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.53 
 
 
111 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  49.14 
 
 
154 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
152 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.65 
 
 
237 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.53 
 
 
111 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  50 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  52.69 
 
 
115 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3576  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.43 
 
 
112 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.515977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  55.68 
 
 
112 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.68 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
155 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4883  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.55 
 
 
125 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  48.28 
 
 
115 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3391  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  48.6 
 
 
111 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  48.6 
 
 
111 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.04 
 
 
113 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1971  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49 
 
 
113 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000209328  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13980  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.43 
 
 
129 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0998449  normal  0.201528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.98 
 
 
310 aa  103  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5623  peptidylprolyl isomerase  49.07 
 
 
131 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588755  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3652  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  52.43 
 
 
297 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0457  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  47.66 
 
 
111 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3572  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  47.66 
 
 
111 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0453  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  47.66 
 
 
111 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634054  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2171  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  47.41 
 
 
154 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125319  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  56.67 
 
 
199 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  48.25 
 
 
119 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.3 
 
 
254 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1988  Peptidylprolyl isomerase  48.15 
 
 
137 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1658  Peptidylprolyl isomerase  47.22 
 
 
137 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0122664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  47.83 
 
 
117 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23499  predicted protein  55.56 
 
 
98 aa  100  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.15 
 
 
117 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0365  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50.48 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  53.26 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  45.61 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  53.26 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0470  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.38 
 
 
244 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  45.61 
 
 
115 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
117 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  52 
 
 
210 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>