More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2529 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2529  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  100 
 
 
113 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2340  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  93.81 
 
 
124 aa  220  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0156483  normal  0.586364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1404  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  78.76 
 
 
113 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16320  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  78.76 
 
 
113 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1971  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  78.76 
 
 
113 aa  186  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000209328  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44220  Peptidylprolyl isomerase  76.99 
 
 
113 aa  184  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0457  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  80.56 
 
 
111 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3572  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  80.56 
 
 
111 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0453  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  80.56 
 
 
111 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634054  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  76.85 
 
 
111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4028  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  76.85 
 
 
111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  76.85 
 
 
111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  76.85 
 
 
111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3640  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  77.88 
 
 
112 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0746275  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  76.85 
 
 
111 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  79.82 
 
 
112 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3879  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  75.22 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3391  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  75 
 
 
111 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1554  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  75.22 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4313  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  76.11 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3576  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  73.45 
 
 
112 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.515977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2207  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  74.31 
 
 
117 aa  166  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.602689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0245  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  68.14 
 
 
109 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0502  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  62.5 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  55.77 
 
 
199 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.63 
 
 
237 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  54.21 
 
 
180 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.21 
 
 
180 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.85 
 
 
143 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  51.4 
 
 
174 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
179 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  51.85 
 
 
197 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.77 
 
 
254 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  55.24 
 
 
199 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.34 
 
 
155 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  52.34 
 
 
155 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  54.29 
 
 
210 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.38 
 
 
135 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  50.96 
 
 
203 aa  114  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.92 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  53.27 
 
 
184 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  53.27 
 
 
184 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  55.77 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.92 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  50.93 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  48.57 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.43 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  55.77 
 
 
190 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1537  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.93 
 
 
124 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104701  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.98 
 
 
159 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.34 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  52.34 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.21 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  55.77 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  50.93 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.66 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.83 
 
 
143 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.45 
 
 
117 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  50.93 
 
 
154 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.89 
 
 
113 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54718  FK506 binding protein proline rotamase rapamycin-binding protein  51.92 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0751  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.34 
 
 
153 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  54.81 
 
 
190 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.89 
 
 
113 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.89 
 
 
113 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.89 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  51.89 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  51.89 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  50.94 
 
 
113 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50.93 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.89 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.88 
 
 
155 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  51.89 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  50.46 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.55 
 
 
117 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.89 
 
 
113 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  54.37 
 
 
157 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2957  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.67 
 
 
163 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  51.89 
 
 
112 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
112 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.4 
 
 
113 aa  105  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1877  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.48 
 
 
125 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  49.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.55 
 
 
117 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.55 
 
 
117 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  48.08 
 
 
140 aa  103  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
140 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.08 
 
 
187 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2244  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.67 
 
 
125 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502602  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.65 
 
 
140 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1803  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.4 
 
 
107 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  48.6 
 
 
114 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1882  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.4 
 
 
107 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1694  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  48.57 
 
 
122 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4883  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.57 
 
 
125 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13980  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.15 
 
 
129 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0998449  normal  0.201528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>