More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2354 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
174 aa  347  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  57.61 
 
 
203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.99 
 
 
179 aa  210  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  54.7 
 
 
180 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  54.7 
 
 
180 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  72 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.98 
 
 
159 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  51.78 
 
 
199 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  55.23 
 
 
167 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.93 
 
 
143 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.64 
 
 
113 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  68.75 
 
 
113 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  68.75 
 
 
113 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.91 
 
 
112 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  69.37 
 
 
113 aa  160  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  65.6 
 
 
152 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.13 
 
 
138 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  71.56 
 
 
112 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  47.37 
 
 
190 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  61.07 
 
 
155 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  67.86 
 
 
113 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  67.86 
 
 
113 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.86 
 
 
113 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  59.84 
 
 
155 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  47.89 
 
 
190 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  68.75 
 
 
113 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  67.86 
 
 
113 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  67.59 
 
 
155 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  56.46 
 
 
154 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  68.75 
 
 
113 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  68.75 
 
 
113 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  45.26 
 
 
190 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.03 
 
 
140 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.03 
 
 
140 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  45.41 
 
 
197 aa  157  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.03 
 
 
140 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  46.84 
 
 
190 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.83 
 
 
140 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.86 
 
 
113 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  43.22 
 
 
199 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  69.09 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  63.87 
 
 
154 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2171  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.87 
 
 
154 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125319  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  65.18 
 
 
114 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  61.29 
 
 
140 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  60.66 
 
 
154 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  44.29 
 
 
210 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  64.91 
 
 
115 aa  151  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  67.57 
 
 
116 aa  151  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.66 
 
 
117 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.91 
 
 
187 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.79 
 
 
117 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  63.79 
 
 
119 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  63.79 
 
 
119 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.39 
 
 
149 aa  148  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.93 
 
 
117 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  68 
 
 
108 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.64 
 
 
114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  61.4 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  62.93 
 
 
119 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.35 
 
 
117 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  61.06 
 
 
115 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.81 
 
 
237 aa  143  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  66.67 
 
 
138 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  60.68 
 
 
117 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  61.95 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0691  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.97 
 
 
119 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  54.32 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  60 
 
 
117 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  60.18 
 
 
115 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  58.33 
 
 
310 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  65.77 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19690  predicted protein  61.34 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.266789  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.89 
 
 
310 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.65 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.75 
 
 
254 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54718  FK506 binding protein proline rotamase rapamycin-binding protein  65 
 
 
112 aa  128  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  58.72 
 
 
310 aa  128  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  58.33 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  58.33 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  59.62 
 
 
140 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0365  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.27 
 
 
115 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2340  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.88 
 
 
124 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0156483  normal  0.586364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1971  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.75 
 
 
113 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000209328  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02370  FK506 binding protein 2, putative  55.56 
 
 
141 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  49.22 
 
 
165 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60 
 
 
107 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0607  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.24 
 
 
206 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000591521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0751  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.88 
 
 
153 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1075  peptidylprolyl isomerase  58.56 
 
 
139 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1935  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  55.45 
 
 
133 aa  121  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3440  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  46.81 
 
 
143 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1738  Peptidylprolyl isomerase  55.45 
 
 
133 aa  121  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.127395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4028  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
111 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2529  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  51.4 
 
 
113 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
111 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
111 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.88 
 
 
111 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3274  Peptidylprolyl isomerase  56.76 
 
 
142 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1300  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signal peptide protein  55.96 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.358981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>