More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0245 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0245  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2207  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  72.73 
 
 
117 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.602689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  76.36 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1971  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.8 
 
 
113 aa  160  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000209328  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3640  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  70.8 
 
 
112 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0746275  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3391  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  72.48 
 
 
111 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4028  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.48 
 
 
111 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.48 
 
 
111 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.48 
 
 
111 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.48 
 
 
111 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  73.39 
 
 
111 aa  156  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1404  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  69.03 
 
 
113 aa  156  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2340  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  68.14 
 
 
124 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0156483  normal  0.586364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0457  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  71.56 
 
 
111 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3572  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  71.56 
 
 
111 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3879  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.91 
 
 
112 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0453  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  71.56 
 
 
111 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634054  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4313  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  69.91 
 
 
112 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44220  Peptidylprolyl isomerase  67.26 
 
 
113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2529  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  68.14 
 
 
113 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1554  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  69.03 
 
 
143 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16320  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  66.37 
 
 
113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3576  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  65.49 
 
 
112 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.515977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0502  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.27 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  50.49 
 
 
190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.46 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  51.46 
 
 
190 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.17 
 
 
108 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  47.62 
 
 
114 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  50.96 
 
 
165 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  50.49 
 
 
190 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
199 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2957  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.52 
 
 
163 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.52 
 
 
237 aa  104  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  48.54 
 
 
197 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  49 
 
 
174 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  46.53 
 
 
210 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47 
 
 
143 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  48.08 
 
 
199 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  48.08 
 
 
165 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48 
 
 
179 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02730  fk506-binding protein 39 kda, putative  47.57 
 
 
405 aa  98.2  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  47.57 
 
 
184 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46 
 
 
180 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  46 
 
 
180 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  47.57 
 
 
184 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.15 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.52 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  46.15 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.96 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  45.19 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  45.54 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  48 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.19 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1882  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.54 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1803  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.54 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.19 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  45 
 
 
203 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.71 
 
 
254 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.36 
 
 
112 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.19 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.19 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  45.19 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  45.19 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.19 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.19 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  45 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  45.19 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44.23 
 
 
114 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54718  FK506 binding protein proline rotamase rapamycin-binding protein  45.71 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10489  FK506-binding protein 4 (EC 5.2.1.8)(Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase)(PPIase)(Rotamase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1B0]  43.69 
 
 
479 aa  91.3  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.451848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.19 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1537  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.22 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104701  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.56 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  43.52 
 
 
154 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5503  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.17 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00337185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  43.52 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  45.37 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  41.35 
 
 
187 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02370  FK506 binding protein 2, putative  47.31 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.19 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  44.34 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.19 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.64 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.28 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  41.9 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1435  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.93 
 
 
144 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.585124  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  45.65 
 
 
167 aa  86.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  43.52 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7175  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.28 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  45.1 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.15 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  42.2 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  44.44 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44.66 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0751  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  42.73 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  44.23 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4883  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.52 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>