More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0874 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  75.38 
 
 
197 aa  289  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19721  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  63.68 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0321847 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  58.91 
 
 
199 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14921  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  56.93 
 
 
190 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14541  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  52.97 
 
 
190 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0860  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  57.75 
 
 
184 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.264963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1389  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  53.96 
 
 
190 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.143322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14781  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  54.95 
 
 
190 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  57.22 
 
 
184 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  48.22 
 
 
174 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  49.49 
 
 
203 aa  174  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.96 
 
 
180 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.96 
 
 
179 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  64.96 
 
 
180 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.74 
 
 
143 aa  161  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  66.07 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
114 aa  158  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  72.73 
 
 
113 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  72.73 
 
 
113 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  52.23 
 
 
167 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  66.96 
 
 
155 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.37 
 
 
112 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.96 
 
 
155 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  70.37 
 
 
113 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  70.37 
 
 
113 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.49 
 
 
237 aa  151  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  69.44 
 
 
113 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  63.33 
 
 
154 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  64.91 
 
 
117 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2152  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  68.22 
 
 
108 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  69.44 
 
 
113 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  61.54 
 
 
149 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  69.44 
 
 
113 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  61.67 
 
 
154 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.72 
 
 
159 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  68.52 
 
 
113 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  68.52 
 
 
113 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  68.52 
 
 
113 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  67.59 
 
 
113 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  62.18 
 
 
155 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.67 
 
 
113 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.83 
 
 
152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  66.07 
 
 
115 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.1 
 
 
138 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0827  peptidylprolyl isomerase  66.07 
 
 
115 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0553692  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  67.59 
 
 
112 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  62.07 
 
 
154 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.29 
 
 
117 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2493  Peptidylprolyl isomerase  63.16 
 
 
119 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3146  peptidylprolyl isomerase  63.16 
 
 
119 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.317376  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  65.49 
 
 
116 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  64.29 
 
 
117 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2171  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  61.21 
 
 
154 aa  141  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125319  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  64.6 
 
 
117 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.39 
 
 
140 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  62.83 
 
 
115 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.16 
 
 
117 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  62.39 
 
 
112 aa  141  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1387  peptidylprolyl isomerase  62.07 
 
 
119 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.719013  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  64.22 
 
 
114 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  61.54 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  60 
 
 
155 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0365  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.72 
 
 
115 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3391  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  59.62 
 
 
111 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  64.29 
 
 
117 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  64.29 
 
 
117 aa  138  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  60.71 
 
 
115 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.65 
 
 
111 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4028  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.65 
 
 
111 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.65 
 
 
111 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.65 
 
 
111 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  60.55 
 
 
310 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  63.89 
 
 
254 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  59.62 
 
 
111 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.71 
 
 
140 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.71 
 
 
140 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.71 
 
 
140 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  69.9 
 
 
107 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  64.04 
 
 
138 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1971  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  59.43 
 
 
113 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000209328  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0457  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.73 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3572  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.73 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0453  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.73 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634054  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0751  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  64.49 
 
 
153 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01512  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.37 
 
 
143 aa  131  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  60.19 
 
 
165 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  63.64 
 
 
157 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.39 
 
 
135 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  66.99 
 
 
107 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1882  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.96 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1803  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  67.96 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0691  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  60.18 
 
 
119 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2244  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.33 
 
 
125 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502602  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2340  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  55.77 
 
 
124 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0156483  normal  0.586364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  58.12 
 
 
124 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.57 
 
 
187 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16320  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FkbP-type  55.77 
 
 
113 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1650  peptidylprolyl isomerase  57.8 
 
 
140 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.294952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0821  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkbP  55.66 
 
 
112 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>