More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0645 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0645  conserved hypothetical transposase  100 
 
 
259 aa  540  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0437717  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1100  conserved hypothetical transposase  99.23 
 
 
259 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00213813  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  91.16 
 
 
327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  91.67 
 
 
327 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  79.82 
 
 
327 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  80.7 
 
 
327 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  78.21 
 
 
278 aa  301  9e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  64.76 
 
 
310 aa  284  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2225  putative transposase  80.74 
 
 
162 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00838667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  42.23 
 
 
342 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  42.23 
 
 
342 aa  198  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  42.23 
 
 
342 aa  198  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  43.83 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2047  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
272 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
317 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  41.6 
 
 
349 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  44.21 
 
 
362 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  44.21 
 
 
362 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  43.44 
 
 
336 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  43.35 
 
 
325 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  43.35 
 
 
325 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  43.03 
 
 
336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  43.03 
 
 
336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  43.03 
 
 
336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 
354 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  41.15 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  40.73 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  42.51 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  38.1 
 
 
355 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  41.43 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  43.51 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  41.04 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
364 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 
354 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 
318 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 
318 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  40.6 
 
 
352 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  37.94 
 
 
364 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  37.94 
 
 
364 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  37.94 
 
 
364 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  40.62 
 
 
375 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 
375 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  39.29 
 
 
375 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3124  hypothetical protein  41.79 
 
 
232 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.010026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  42.93 
 
 
294 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  43.33 
 
 
275 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  43.33 
 
 
275 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  43.33 
 
 
275 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  38.08 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  38.19 
 
 
438 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>