154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2225 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2225  putative transposase  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00838667  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  98.52 
 
 		 327 aa  276  8e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  82.91 
 
 		 327 aa  262  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  83.7 
 
 		 327 aa  237  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1100  conserved hypothetical transposase  81.48 
 
 		 259 aa  226  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00213813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0645  conserved hypothetical transposase  80.74 
 
 		 259 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0437717  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  80.74 
 
 		 327 aa  223  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  98.84 
 
 		 278 aa  179  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  52.52 
 
 		 310 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3124  hypothetical protein  41.88 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.010026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  45.6 
 
 		 325 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  46.76 
 
 		 362 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  46.76 
 
 		 362 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  45.6 
 
 		 325 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  43.26 
 
 		 342 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  43.26 
 
 		 342 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  43.26 
 
 		 342 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 341 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2047  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 272 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 317 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  39.72 
 
 		 355 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 349 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 347 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  39.44 
 
 		 347 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  38.85 
 
 		 352 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  34.56 
 
 		 331 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  38.85 
 
 		 354 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 327 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  39.02 
 
 		 319 aa  87.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  39.06 
 
 		 363 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  38.85 
 
 		 375 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3413  putative transposase  40.8 
 
 		 188 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  47.44 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  47.44 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  47.44 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  38.22 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  38.22 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4008  hypothetical protein  40.91 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1232  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1848  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>