142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01435 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01435  proline racemase  100 
 
 		 237 aa  476  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312983  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3379  hydroxyproline-2-epimerase  62.55 
 
 		 310 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4226  hydroxyproline-2-epimerase  62.13 
 
 		 359 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4140  hydroxyproline-2-epimerase  62.13 
 
 		 359 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.465204  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1894  hydroxyproline-2-epimerase  61.7 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4133  proline racemase  59.15 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4447  hydroxyproline-2-epimerase  61.18 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1840  proline racemase  60 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2499  proline racemase  58.3 
 
 		 309 aa  279  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.293711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0874  putative proline racemase  60.76 
 
 		 318 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4031  hydroxyproline-2-epimerase  60.34 
 
 		 311 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1258  proline racemase  57.45 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2705  proline racemase  59.49 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3550  hydroxyproline-2-epimerase  60.76 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4560  proline racemase  59.83 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1285  proline racemase  57.45 
 
 		 308 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2308  proline racemase  57.45 
 
 		 308 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2067  hydroxyproline-2-epimerase  59.49 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4122  hypothetical protein  59 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0159506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5220  4-hydroxyproline epimerase  58.9 
 
 		 312 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0432032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1044  proline racemase  57.44 
 
 		 317 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47840  hypothetical protein  58.16 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  57.08 
 
 		 344 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1219  proline racemase  51 
 
 		 332 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1887  hydroxyproline-2-epimerase  59.07 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0570  hydroxyproline-2-epimerase  59.07 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568188  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0473  hydroxyproline-2-epimerase  59.07 
 
 		 310 aa  254  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1419  hydroxyproline-2-epimerase  59.07 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2195  hydroxyproline-2-epimerase  59.07 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186223  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0881  hydroxyproline-2-epimerase  59.07 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0052  proline racemase  50 
 
 		 311 aa  240  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2713  4-hydroxyproline epimerase  50.62 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3199  proline racemase  50.42 
 
 		 308 aa  224  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317933  normal  0.850196 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  36.76 
 
 		 333 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  36.76 
 
 		 333 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  37.5 
 
 		 337 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  37.01 
 
 		 333 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  35.27 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  37.65 
 
 		 334 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  34.5 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  33.86 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  35.04 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  33.99 
 
 		 301 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  35.83 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  34.51 
 
 		 333 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  33.07 
 
 		 333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  32.94 
 
 		 333 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  34.12 
 
 		 333 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  35.38 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  34.11 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  34.25 
 
 		 333 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  34.51 
 
 		 335 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  34.38 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  33.08 
 
 		 333 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  32.28 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  32.95 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  32.56 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  36.67 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  33.33 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  30.34 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  33.07 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  34.5 
 
 		 332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  35.16 
 
 		 336 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  33.85 
 
 		 332 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  35.04 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  30.77 
 
 		 345 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  30.77 
 
 		 345 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  30.98 
 
 		 345 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  31.1 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  30.59 
 
 		 345 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  30.71 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  32.54 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  33.6 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  30.77 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  30.77 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  30.77 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  30.71 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  30.77 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  30.59 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  30.59 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  30.98 
 
 		 335 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  30.59 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  31.5 
 
 		 338 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  33.58 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  32.14 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  35.39 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  33.99 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  31.37 
 
 		 335 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  30.98 
 
 		 335 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  30.59 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  30.98 
 
 		 335 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  30.59 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  31.37 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  31.37 
 
 		 335 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  27.89 
 
 		 331 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  27.89 
 
 		 331 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  26.88 
 
 		 331 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3975  proline racemase  31.87 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  26.4 
 
 		 331 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  29.48 
 
 		 337 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>