122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00752 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00752  transcriptional regulator protein Pai2  100 
 
 		 107 aa  216  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.425403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  55.34 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  37.14 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  37.14 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  37.14 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  36.19 
 
 		 219 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  37.14 
 
 		 199 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.24 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 214 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.35 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  39.29 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.07 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.11 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  34.04 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  34.04 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  34.04 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  34.04 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  34.04 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  38.39 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  46.59 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  32.98 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.45 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  43.02 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  35.24 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0621  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.609776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  39.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.66 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 212 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 227 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  37.96 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  44.93 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  38.68 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.94 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  39 
 
 		 209 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 214 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  37.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  37.74 
 
 		 253 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 202 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>