72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59054 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_59054  phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase  100 
 
 
2122 aa  4383    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.881067  normal  0.212079 
 
 
-
 
NC_006686  CND03330  1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase, putative  45.21 
 
 
2384 aa  383  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434062  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01630  hypothetical protein  28.95 
 
 
1841 aa  152  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  32.02 
 
 
538 aa  99.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  30.05 
 
 
559 aa  94.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05211  1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase (Fab1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07440)  47.37 
 
 
108 aa  91.3  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  29.28 
 
 
527 aa  90.5  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 
567 aa  89  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49524  predicted protein  26.9 
 
 
926 aa  81.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.168314  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  27.05 
 
 
553 aa  80.1  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  27.05 
 
 
553 aa  80.1  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02766  multicopy suppressor of stt4 mutation (AFU_orthologue; AFUA_3G06080)  32.4 
 
 
841 aa  77.4  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.85987  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  24.63 
 
 
543 aa  72.4  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64487  Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  32.57 
 
 
441 aa  71.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000874967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  24.02 
 
 
500 aa  71.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  30.91 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11720  predicted protein  34.52 
 
 
69 aa  68.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  24.71 
 
 
558 aa  67  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  24.71 
 
 
560 aa  67  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03760  1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, putative  30.36 
 
 
842 aa  66.2  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  25.98 
 
 
553 aa  65.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  25.26 
 
 
543 aa  63.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  24.51 
 
 
554 aa  63.2  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  23.18 
 
 
553 aa  62.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  25.7 
 
 
543 aa  58.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  24.07 
 
 
547 aa  58.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  22.67 
 
 
539 aa  58.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  23.67 
 
 
560 aa  57.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  27.08 
 
 
535 aa  57  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  23.5 
 
 
543 aa  56.6  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  22.87 
 
 
551 aa  56.2  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  21.74 
 
 
570 aa  56.2  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  26 
 
 
545 aa  56.2  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  24.27 
 
 
542 aa  55.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  24.87 
 
 
558 aa  55.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47389  predicted protein  22.32 
 
 
591 aa  54.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00749667  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.27 
 
 
551 aa  53.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  24.42 
 
 
570 aa  53.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  23.5 
 
 
551 aa  53.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  22.58 
 
 
542 aa  53.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  28.06 
 
 
562 aa  53.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  24.31 
 
 
545 aa  52.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  24.31 
 
 
542 aa  52.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66581  DNA-binding proteins Bright/BRCAA1/RBP1 and related proteins containing BRIGHT domain-containing protein  26.95 
 
 
794 aa  52  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.333138 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  24.29 
 
 
559 aa  52  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  23.65 
 
 
553 aa  51.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16608  predicted protein  30.14 
 
 
57 aa  51.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  25.75 
 
 
537 aa  51.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  25.12 
 
 
553 aa  51.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18669  predicted protein  25 
 
 
483 aa  51.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.820823  normal  0.187345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  20.43 
 
 
563 aa  51.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67308  Zn finger protein  31.52 
 
 
836 aa  50.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106701  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  22.91 
 
 
557 aa  49.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  22.83 
 
 
558 aa  49.3  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02080  vesicle fusion-related protein, putative  51.43 
 
 
839 aa  49.3  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  23.04 
 
 
552 aa  49.3  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19381  predicted protein  44.74 
 
 
379 aa  48.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.797995  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  23.57 
 
 
557 aa  49.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  24 
 
 
577 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03144  vacuolar segregation protein (Pep7), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13770)  29.89 
 
 
675 aa  48.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0281891  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00627  FYVE domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17070)  28 
 
 
281 aa  48.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.805951  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14387  predicted protein  22.73 
 
 
371 aa  48.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  22.22 
 
 
554 aa  47.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  23.58 
 
 
550 aa  47.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59466  predicted protein  28.26 
 
 
685 aa  47.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02071  Vacuolar protein sorting-associated protein 27 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBK9]  43.75 
 
 
715 aa  47.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0187847  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  21.07 
 
 
559 aa  47  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36619  vacuolar protein sorting-associated protein hydrophilic protein  44.12 
 
 
732 aa  46.6  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0311828  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  24.64 
 
 
552 aa  46.2  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  22.94 
 
 
558 aa  46.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  21.54 
 
 
540 aa  45.8  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  23.36 
 
 
542 aa  45.8  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>